为履行中央企业的使命与责任，推进两岸和平繁荣，促进两岸交流合作，迎接海峡两岸“三通”，原中远集团于1993年10月28日正式成立了厦门远洋运输公司。根据国务院国资委、中远海运集团的相关要求，2017年10月27日，厦门远洋运输公司改制更名为中远海运（厦门）有限公司，简称厦门中远海运。

厦门中远海运是中国远洋海运集团有限公司目前在福建地区唯一的全资二级子公司，注册资金129,035万元，公司主要从事对台客货运业务和国际间干散、杂货运输业务，拥有对台小三通高速客船1艘、对台大三通客滚船1艘、散杂兼营船5艘、运木船2艘、合资邮轮1艘。下属合资合营企业4家。

厦门中远海运长期坚持“安全第一，客户至上”的经营理念，为广大客户提供安全、优质的海上运输服务。在远洋货运方面，公司目前主要经营远东--中美洲等不定期货运班轮运输品牌航线，主要承接设备、钢材、金属矿、粮食、矿砂、煤炭、化肥、蔗糖等货物运输服务。在发展远洋运输的基础上，公司积极发挥集团的品牌优势和地处海峡西岸的区位优势，在两岸海上交流实践中做了大量首创性工作，于2007年—2009年间作为唯一航运央企开通了对台大、小三通客货运业务。小三通“新五缘”轮经营厦门/金门客运航线；大三通“中远之星”轮经营厦门/基隆、厦门/台中和浙江大麦屿/基隆三条对台客滚直航航线，为扩大两岸人员往来、促进两岸“三通”和闽台经贸合作人员往来、促进两岸融合发展做出积极贡献。

经过多年的发展，厦门中远海运已形成了独具特色的经营管理体系和企业文化，逐渐构建了以“大小三通”海上客货运输为对台航运品牌和以杂货准班轮航线为远洋货运品牌的双品牌格局，同时按照中远海运集团的产业规划和布局，积极探索邮轮业务发展，已成为海峡西岸地区具有重要影响力的综合性航运企业。